氫是結構最簡單的分子，燃燒後只有水，被視為終極潔淨能源。全球淨零排放趨勢下，政府於2022年3月公布「臺灣2050淨零排放路徑」，目標2050年，氫氣發電將占9%到12%。呼應政府能源轉型策略，工研院亦於同年6月發布「臺灣2050氫應用發展技術藍圖」，從發電、載具、工業三大氫能應用方，提出未來30年臺灣氫能用技術的發展策略，打造氫能新商機。

氫可主要透過燃料電池產生電力，早在1987年工研院即投入燃料電池的研究，2002年成立「台灣燃料電池夥伴聯盟」，整合燃料電池上中下游，提升產業的技術能力，為我國的氫能應用奠定基礎；2006年更將氫燃料電池的關鍵零組件「雙極板技術」技轉產業，為國內氫能產業播下種子，吸引更多廠商投入燃料電池生產；2015年，位於六甲院區的氫能源站通過國際認證，成為亞洲第一個通過UL評鑑的燃料電池測試認證實驗室；2022年成立以金屬板為核心的新創公司，積極推動氫能應用領域電池。

工研院也發表多項包含氫氣產製、儲存與應用的技術，包括低成本、高效率的「高效濾氫純化模組」，可純化半導體、石化製程餘氫，進行回收再利用；「再生能源電解產氫系統」，以自行研發的觸媒／膜材技術來產氫，達到高效率、低成本與零汙染的多重效益；以碳纖維複材搭配自動纏繞技術生產的「載具用儲氫氣瓶」，應用於氫能車更輕巧、安全；「氫燃料電池系統」則利用工業餘氫發電，與亞氫動力、帆宣科技等廠商合作，打造自有技術能量，建立臺灣氫能產業鏈，達成2050年淨零排放最後一哩路。